как исправить косяк с геометрией

В тех местах где перекрывает отверстие полигон возникает глюк из за того что у тебя нету еджей дополнительных которые должны розсикать большой полигон, сам полигон неможет изгибатся вокруг отверстия. Смотри картинку вложеною.